| 党政管理部门 | 党委办公室、院长办公室（外事与港澳台办公室） |
| 党委组织部、党委统战部（合署） | |
| 党委宣传部（新闻中心、文明办） | |
| 纪委办公室 | |
| 党委教师工作部、人事处（教师发展中心） | |
| 教务处、创业学院、督导处（合署） | |
| 科技与地方合作处 | |
| 党委学生工作部、学生处、人民武装部（合署） | |
| 招生就业处、校友联络办公室（合署） | |
| 审计处 | |
| 计划财务处 | |
| 实训管理处（公共实训中心管理办公室） | |
| 保卫处 | |
| 基建与资产管理处（招标办） | |
| 教学单位 | 建筑工程学院 |
| 机电与汽车工程学院 | |
| 物流与信息工程学院 | |
| 商贸与经济管理学院 | |
| 旅游与公共管理学院（湖州国际旅游学院） | |
| 艺术设计学院 | |
| 继续教育学院（农民学院办公室、社区大学办公室、湖州高新职业技能培训中心） | |
| 马克思主义学院 | |
| 体育教研部 | |
| 群团组织 | 工会（离退休人员管理服务办公室） |
| 团委 | |
| 妇女工作委员会 | |
| 直属单位 | 图书馆 |
| 现代教育技术中心 | |
| 职业教育研究所、学报编辑部（合署） | |
| 档案室 | |
| 后勤服务部门 | 资产经营公司 |
| 湖州新宇教育发展有限公司 | |
